全书共包括十章内容，以临床工作中诊断明确的住院病例为纲，展开叙述。每个疾病都分为三部分。 ???部分为病历摘要。对诊断明确的典型病例进行概述，按照患者主诉、体征、辅助检查、入院诊断等格式加以叙述。 ???第二部分为查房过程。通过临床查房将所述疾病的诊断线索、诊断标准、治疗方法和进展贯穿其中。每一病例的查房，首先归纳该病人的临床特点，设下悬念，上级医师给出解决的方法和步骤，并对检查结果和治疗效果进行分析、判断、综合、评价，最后得出明确的诊断，进行合理的治疗。 ???第三部分为专家点评。通过专家对具体病例的诊治点评和对具体疾病诊疗环节的分析，让读者对疾病的发生、发展到结局有个完整的了解，帮助读者从中吸取经验教训。
《消化疾病诊疗指南》共分4篇，分别为消化系疾病常见症状，食管、胃、肠道、肝脏、胆系、胰腺、腹膜及肠系膜等消化系疾病各论，消化系统诊断和治疗技术，消化系疾病常用药物。各论部分疾病介绍包括病因和发病机制、病理、诊断、治疗、预后等内容，以反映出疾病流行病学变化、对发病机制新的认识、新的诊疗方法以及新的临床循证医学指南。《消化疾病诊疗指南》具有系统、实用、科学、简练的特点，可作为消化内科医师常备参考书。
《临床主治医师问答丛书：消化内科主治医师563问》共11章，包括：消化系统解剖生理特点、消化系统疾病常见症状、食管疾病、胃及十二指肠疾病、肝疾病、胆道疾病、胰腺疾病、腹膜疾病、肠道疾病、消化道中毒及消化系统疾病常用诊疗技术。《临床主治医师问答丛书：消化内科主治医师563问》除对临床主治医生常遇到的重要问题外，着重对近年来的新理论、新技术和新进展等有关问题采用问答形式，以当今观点进行解答、阐述，内容力求新颖、重点突出、简明实用，是基层医院消化内科医师、全科医师的重要参考书。
