女高中生侦探世良真纯的举动很有深意！ 赤女事件迎来了意想不到的结局！在这次的犯罪事件中，可以窥见真纯的部分真实想法！ 另外，在恋爱小说家事件中，柯南发现了谜一样的少女？！ 同时青山刚昌编著的《名侦探柯南》收录了柯南与平次共同战斗的毒品交易事件！！更有新一华丽登场的水族馆事件！！
前情提要： 帝丹高中二年级的工藤新一侦破了无数棘手案件，是被誉为[日本警察的救世主]的高中生名侦探。 某天，新一如女朋友毛利兰约会时，碰到全身黑衣黑帽的可疑男子，因好奇心的驱使而跟踪他们。 然后，新一目睹了不明组织恐吓人的情景，对方为了杀人灭口，就把一种新发明的毒药灌进他的嘴里……结果，他的身体竟然变小了……
少年侦探团，在机缘巧合下和很受欢迎组合TWO-MIX的主唱高山美奈美一起吃饭，高山为找搭档永野椎菜，一人跑出了演唱会的会场。后来在餐厅外，歹徒当着柯南的面将高山推入车中绑架，他们要求少年侦探团拿着TWO-MIX近期新的歌曲练习带去交换人质，歹徒在电话里让少年侦探团把警察甩掉并让步美一人前去，于是柯南和步美调换身份。
