《名侦探柯南：特别篇23》主要介绍：帝丹学生工藤新一，解决了无数棘手事件，是被誉为“日本警察的救世主”的生名侦探。某天，新一和女朋友毛利兰约会时，发现可疑的黑衣男子，他出于好奇跟踪了他们。然后新一目睹了谜一样的组织的恐吓现场，为了灭口，黑衣男子给新一灌下了组织新开发的毒药……结果他的身体竟然变小了！困扰的新一为了隐藏真实身份，化名为“江户川柯南”，住进了小兰家——毛利侦探事务所，开始追踪神秘黑衣组织的行踪……为了掩人耳目，新一甚至上了小学，私底下则不辞辛劳地帮助毛利破案。
小小的名侦探江户川柯南的真实身份是高中生名侦探工藤新一。借住在女朋友小兰家，也就是[毛利侦探事务所]里，一边追踪把自己身体变成小孩的黑衣组织，一边解决着无数的困难事件。 柯南为了调查黑衣组织的女子水无怜奈，特地把服部从大阪叫了过来。 两个人解决了寺庙里发生的怪事件后不久，服部就带着柯南去了无人岛参加日卖IT策划的[侦探甲子园]的节目。 那里集中了全国各地的高中生侦探，但是北部的高中生侦探时津被发现在密室里混身沾满了血迹死亡了……？！
