前情提要： 帝丹高中二年级的工藤新一侦破了无数棘手案件，是被誉为[日本警察的救世主]的高中生名侦探。 某天，新一如女朋友毛利兰约会时，碰到全身黑衣黑帽的可疑男子，因好奇心的驱使而跟踪他们。 然后，新一目睹了不明组织恐吓人的情景，对方为了杀人灭口，就把一种新发明的毒药灌进他的嘴里……结果，他的身体竟然变小了……
女高中生侦探世良真纯的举动很有深意！ 赤女事件迎来了意想不到的结局！在这次的犯罪事件中，可以窥见真纯的部分真实想法！ 另外，在恋爱小说家事件中，柯南发现了谜一样的少女？！ 同时青山刚昌编著的《名侦探柯南》收录了柯南与平次共同战斗的毒品交易事件！！更有新一华丽登场的水族馆事件！！
柯南一行人因为一封寄给平次的信而踏上了人鱼居住的岛屿……那座岛上有一位据说曾经吃过人鱼肉，因而得以长生不老，人称“命样”的一百三十岁的老婆婆在等待着他们！！从这一夜开始，连续杀人案正式揭开序幕！
满月之时，幽灵船上的鬼怪化装舞会推理，与组织的面对面对决！一边是“工藤新一”大秀推理，另一边柯南、灰原、朱蒂、Vermouth、Gin、赤井秀一等人或明或暗一一登场，情节诡异绝伦，一触即发，这场较量究竟会以何种形式落幕，本卷会将所有精彩展现！
发生在公馆里的杀人事件，死者无一例外全被吊死，身上交错缠绕着纷乱的线，就如同蜘蛛网线一般，公馆里的人们也认为这是蜘蛛大人的行为……柯南和服部平次一同展开调查，然后，危机也发生在了和叶的身上…… 柯南一行人进入钟乳洞里探险，没想到遇到了银行抢匪，柯南腹部中弹！少年侦探团的成员这一次如何顺利度过危机呢？
小小侦探江户川柯南，其实他的真实身分就是高中生侦探——工藤新一，目前正隐姓埋名，寄居在女友小兰家开设的毛利侦探事务所里。虽然他积极查访强灌自己喝毒药的黑衣男子下落，不过却还是一无所获。另一方面，毛
小兰又开始怀疑柯南的真实身份了，万般无奈之下，柯南决定求助于灰原，联手在小兰面前演一出戏，并趁机用半吊子解药恢复一下身份，然而……在此关口，罪案又发生了，时间紧迫，柯南该怎么办呢？ 收到已经去世的未见面朋友的短信？还有价值两亿日元的宝贝，本卷之中将一一点明。
小学里埋藏时间胶囊的地点的提示……居然是宫野明美留下来的暗号？！柯南和灰原开始挑战解开暗号！！知名法式餐厅里响起了 声；柯南追踪被带走的博士，出现在他面前的“风之女神”的真实身份是——？另外，盯上了秘宝的基德，和他对峙的竟是——安室透！
美妙的奏鸣曲与残酷的杀人事件……隐藏在乐曲之间的暗号，凶手的身份如此出人意料，柯南身陷烈火究竟如何应对？本章将为您带来这一精彩故事。 柯南……工藤新一的女朋友来到了毛利兰面前，据说他们接吻过？！小兰怒不可遏，柯南暗自叫屈，然而，这究竟是怎样一回事呢？
少年侦探团，在机缘巧合下和很受欢迎组合TWO-MIX的主唱高山美奈美一起吃饭，高山为找搭档永野椎菜，一人跑出了演唱会的会场。后来在餐厅外，歹徒当着柯南的面将高山推入车中绑架，他们要求少年侦探团拿着TWO-MIX近期新的歌曲练习带去交换人质，歹徒在电话里让少年侦探团把警察甩掉并让步美一人前去，于是柯南和步美调换身份。
园子的亲戚，铃木财团的顾问次郎吉，在报纸上向怪盗基德发出了挑战书，让他来偷海蓝宝石——“大海的奇迹”。接受了挑战的基德在森严的警备下和众人惊讶的目光中登场！柯南vs基德的智慧比拼，究竟谁是赢家？
小小的名侦探江户川柯南的真实身份是高中生名侦探工藤新一。 借住在女朋友小兰家，也就是[毛利侦探事务所]里，一边追踪把自己身体变成小孩的黑衣组织，一边解决着无数的困难事件。 柯南为了调查黑衣组织的女子水无怜奈，特地把服部从大阪叫了过来。 两个人解决了寺庙里发生的怪事件后不久，服部就带着柯南去了无人岛参加日卖IT策划的[侦探甲子园]的节目。 那里集中了全国各地的高中生侦探，但是北部的高中生侦探时津被发现在密室里混身沾满了血迹死亡了……？！
以福尔摩斯式的推理能力而声名大噪的高中生名侦探·工藤新一，在一次追线索时，被歹徒强行灌下不知名的药，一夜之间变成了一个小孩，化名为“江户川柯南”。《名侦探柯南》是一部相当具有益智性的漫画，你可以和柯南比比看，谁先找出凶手。 我周围的人相继遭到了袭击？！现场都有一张扑克牌……被害人的姓名里面都有数字？！我的真名——工藤新一——里面也有数字“一”？！谁将是下一个被袭击目标呢？！
