本书系统梳理凝练了水专项“十一五”主要成果，提出了水污染防治单项技术和集成技术的技术就绪度评价方法，建立了水专项技术评估与集成方法，并对洱海56项技术进行了评估分析。围绕污染源系统治理技术、水体修复技术两大技术系统，基本构建形成了系统、完整的水污染治理技术体系；围绕着饮用水安全保障工程技术、全过程饮用水安全监管技术两大技术系统，基本构建形成了全流程、多层级的饮用水安全保障监管技术体系；集成形成了水环境管理、总量控制、风险管理和政策保障技术系统，初步构建我国水环境管理技术体系。
《蓝藻水华生态防治新理论与新技术》前半部分（章至第三章）介绍了水体富营养化过程，以及蓝藻水华的类型、暴发机制及危害，比较了治理蓝藻水华的不同途径，然后从生态治理和生物操作技术角度，结合水文动力学，提出了生态治理蓝藻水华的新思路，即“生态陷阱”治理蓝藻水华。该技术利用风场、水体流场和蓝藻自身水平迁移规律，在蓝藻水华暴发的早期，识别出大面积水体蓝藻控制的关键区域（这些关键区域是蓝藻早期暴发的重点区域，相对整个水域而言，面积较小，易于实行低成本的人工控制），并在这些关键区域内利用水流流量调控结合食物链控藻方法，建立了蓝藻、滤食鱼类、底栖动物三者的全新动态关系模式；同时发展出水体浊度调控技术.充分发挥了滤食鱼类形成泥质含藻粪便的作用，使大量蓝藻随之沉至库底而不致再度*扩散，并被底
